統計的に20%の人々が新型コロナに感染して無症状らしいですが、今回科学者達は無症状に関連する遺伝子を見つけ出しました。

研究者は約3万人の患者のHLAアレルを調査、そのうち1400人がワクチン接種前に新型コロナウイルスに感染するも136人が無症状だったそうです。これらの人の遺伝子を分析したところ関連する遺伝子が発見されました。この遺伝子は以前に普通の風邪（普通風邪の一部はコロナウイルス）に感染した人の免疫細胞に新型コロナウイルスにも対応出来るようにし、新型コロナウイルスを感染症状が出る前に素早く殺すことが出来るそうです。

ちまたの新型コロナに関する議論は誰もが平等に感染すると見なして行われていますが、実際は個々人の持つ遺伝子の多様性を原因として「感染すると大変な事になる人」「ほどほどで済む人」「まったく症状も出ない人」は決まっているんでしょうね。

• 

  A common allele of HLA is associated with asymptomatic SARS-CoV-2 infection | Nature

• 

  Asymptomatic COVID-19 is linked to a gene variant that boosts immune memory after exposure to prior seasonal cold viruses

• 

  Had COVID but no symptoms? You might have this genetic mutation 1 users

• Asymptomatic COVID-19 linked to HLA gene variant and exposure to the common cold - ABC News

　Keyword:ワクチン/277 風邪/108

二日酔い予防に便利な「ウルソ(UDCA:ursodeoxycholic acid)」がコロナ予防に強力な効果。ACE2を選択的に阻害し、細胞表面の量を減らす。

個人的にウルソとウコンのタッグを二日酔い防止の最強コンビネーションとして使ってますが、ウルソはコロナ予防に有効らしいです。なんとACE2の選択的阻害剤として働くだけでもすごいのに、FXR経由でACE2の発現を減らすらしい。

• 【増補版】ウルソでコロナ予防(Biotoday)
• Drug that targets ACE2 receptors may work against new covid variants | New Scientist

• 

  The off-patent drug that could protect us from future COVID-19 variants213イイネ

• 

  A liver disease drug could be repurposed to protect against COVID ? new research

• FXR inhibition may protect from SARS-CoV-2 infection by reducing ACE2 | Nature

• 

  Amazon | 【第3類医薬品】タナベ胃腸薬ウルソ 10錠 ×5 | 田辺三菱製薬 | 胃腸改善

　Keyword:ウコン/6

オミクロン株に感染しても既存のデルタなどの株への感染防御能はつかない

これは重要な結果かもしれません。

出典:Human primary Omicron BA.1 and BA.2 infections result in sub-lineage-specific neutralization, https://doi.org/10.21203/rs.3.rs-1536794/v1
上記の図は元論文に日本語で注釈入れたものですが、d、eで示すようにワクチン接種を受けずにオミクロンに感染した人は既存のオリジナル株、デルタ株への防御能がゼロに近いです。オミクロンB2株に至ってはオミクロンB1株も防げ無さそう。ただfに示すようにワクチン接種を受けた後にオミクロンに感染した人は、既存株、オミクロン株全てに良い免疫が付いています。

• Omicron infection induces limited immune response in unvaccinated; COVID hospital deaths rise on weekends | Reuters

• 

  Omicron variant infections leave unvaccinated at risk for new variants - Deseret News

• Human primary Omicron BA.1 and BA.2 infections result in sub-lineage-specific neutralization | Research Square

新型コロナワクチンによる心筋への副作用は他のワクチンより高く無く、実際に新型コロナに感染した時より低い

• 

  ‘Very Low’ Risk Of Heart Issues After Covid Vaccination, Large Study Finds

• Heart inflammation after Covid vaccine ‘no more common than after other jabs’ | Vaccines and immunisation | The Guardian
• Studies Confirm Covid Shots Have Low Heart Health Risks | Kaiser Health News

• 

  Myocarditis risk higher after Covid infection than vaccination, CDC finds

　Keyword:筋肉/162

新型コロナの後遺症は老化の促進が原因のようだ、老化細胞除去薬「セノリティクス」投与で後遺症を回復させる動物実験

↓研究では新型コロナウイルス（MA10株)を投与して感染させたマウスに老化細胞除去薬ABT263を投与して体重の回復が早まり、各種老化、炎症マーカーが減少することを報告しています。

出典：SARS-CoV-2 infection triggers paracrine senescence and leads to a sustained senescence-associated inflammatory response, Nature Aging

アメリカ・アーカンソー州の研究者からの報告ですが、この報告はこの研究者らが開発中の独自の老化細胞除去薬ABT263の宣伝かな？

• 

  新型コロナの後遺症は感染細胞周囲の細胞老化が関係している、阪大が確認 | TECH+ 3 users

• SARS-CoV-2 infection triggers paracrine senescence and leads to a sustained senescence-associated inflammatory response | Nature Aging

• 

  Clearance of senescent cells by ABT263 rejuvenates aged hematopoietic stem cells in mice - PubMed

　Keyword:フィセチン/210

新型コロナワクチン3回目投与のブースト効果を7種類のワクチンで比較した研究結果が発表。1種類ダメなワクチンが発見される笑

フランスのValnevaって会社のワクチン打っても全然効いてない。やっぱり3回目はビオンテック/ファイザーとモデルナが強いなー

A:1回目2回目がノバックスのワクチン


B:1回目2回目がビオンテック/ファイザーのワクチン

• ChAd・・・・アストラゼネカ社ワクチン
• NVX・・・・ノバックス社ワクチン
• BNT・・・・ビオンテック/ファイザー社ワクチン
• VLA・・・・Valneva社ワクチン
• m1273・・・モデルナ社ワクチン
• CVn・・・・CureVac社ワクチン
• Ad26・・・・ジョンソン＆ジョンソン社ワクチン

• Safety and immunogenicity of seven COVID-19 vaccines as a third dose (booster) following two doses of ChAdOx1 nCov-19 or BNT162b2 in the UK (COV-BOOST): a blinded, multicentre, randomised, controlled, phase 2 trial 1 usersLancet, December 02, 2021
• Safety and immunogenicity of seven COVID-19 vaccines as a third dose (booster) following two doses of ChAdOx1 nCov-19 or BNT162b2 in the UK (COV-BOOST): a blinded, multicentre, randomised, controlled, phase 2 trial - ScienceDirect

　Keyword:モデルナ/17

ファイザーのコロナ飲み薬「パクスロビド（Paxlovid）」、入院・死亡リスク9割減

• 新型コロナ: 米ファイザーのコロナ飲み薬、入院・死亡リスク9割減: 日本経済新聞 293 users

大阪大学の研究者、既存のワクチンがかなり効きにくい改良デルタ株「Delta 4+」の作製に成功。

「デルタ君にも生き延びる道はあることを見つけた！前もってこの人工変異株に対するワクチン/治療薬を準備しておこうぜ。」とのこと。

• 

  The SARS-CoV-2 Delta variant is poised to acquire complete resistance to wild-type spike vaccines | bioRxiv 11 users2075イイネ

• 大阪大学微生物病研究所免疫化学分野 研究業績

モデルナの新型コロナワクチン投与6か月後の戦闘力の変化。抗体価は100万→10万程度に低下

• Antibody Persistence through 6 Months after the Second Dose of mRNA-1273 Vaccine for Covid-19 - PubMed5イイネ

投与直後は初期状態のフリーザより強いじゃないか。2021年6月にNEJMという有名な雑誌で報告された研究結果です。

Safety and Immunogenicity of SARS-CoV-2 mRNA-1273 Vaccine in Older Adults. N Engl J Med. 2020 Dec 17;383(25):2427-2438. doi: 10.1056/NEJMoa2028436. Epub 2020 Sep 29.

モデルナワクチンを投与されたヒトの抗体価、中和活性、より高度な中和活性（生きたウイルスを使ったテスト、FRENT-ｍNG）をワクチン接種から6か月後に行い数値の変化を見ています。

3種類の分析方法：

抗体価	血液中に含まれる新型コロナウイルスに結合する抗体数（※抗体価100万：100万倍に希釈すると測定出来なくなる）
中和活性	新型コロナと同じタンパクを発現する別のウイルスの感染をどれぐらい防げるか
FRENT-mNG	測定しやすいように光るように遺伝子改変した新型コロナウイルスの感染をどれぐらい防げるか

半年で抗体量は年齢層によらず10分の1程度になってますが、中和活性は55歳以下では2〜3分の1程度に下がっている程度。
抗体価としては6か月経過後には1回目投与ぐらいに下がっていると言えますが、中和活性で見ると1回のみ投与時とはくらべものにならない値を保っています。

(省略されています。全文を読む）

新型コロナウイルスの「持続感染者」の体内は早いスピードでウイルス変異が進んでおり、変異株誕生の温床になりうる

ウイルス変異株はどこから来るのか？それは持続感染を起こした患者の体内からかもしれないという報告です。

ハーバード・メディカルスクールの研究者らによる報告。新型コロナウイルスに複数回感染する再感染者や、持続的に感染する持続感染者の存在が報告されています。これらの患者の体内でウイルスにどうような変化が起きているのかを調査しています。

調査対象は20人の再感染者と9人の持続感染者。

再感染者では1回目の感染時と比較し、再感染したウイルスは平均（中央値）で17.5個のアミノ酸変異が見られました。変異は主にORF8とN遺伝子に入っていましたが、この頻度は、世の中で進む遺伝子の変異速度と大きな変化はありませんでした。

一方で、持続感染者では状況は違うようです。上のグラフでは持続感染を起こした患者のサンプルから繰り返しウイルスを抽出して遺伝子配列を調べたものですが、患者体内で早いスピードでウイルスの遺伝子変化が進んでいることが分かりました。持続感染は免疫抑制状態の患者でよく見られますが、ウイルス変異株の発生に関与していると言えます。

• Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) Sequence Characteristics of Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) Persistence and Reinfection | Clinical Infectious Diseases | Oxford Academic8イイネ

アメリカCDCが3種のワクチンの感染防御率、抗体価の比較を発表。

• 

  Comparative Effectiveness of Moderna, Pfizer-BioNTech, and Janssen (Johnson & Johnson) Vaccines in Preventing COVID-19 Hospitalizations Among Adults Without Immunocompromising Conditions ? United States, March?August 2021 | MMWR220イイネ

Natureでコロナウイルスワクチンで初めて実用化されたmRNAワクチンの歴史！

Natureダイジェストの説明文

COVID-19のパンデミックで実用化の機会を得たmRNAワクチン。その出発点は1987年に行われた画期的な実験にあった。だが、果たしてその功績は誰にあるのか。技術的な課題はもとより、特許権争い、研究資金不足、人間関係など、mRNAワクチン開発の紆余曲折の物語を紹介する。

• Natureダイジェスト編集部(twitter)

• The tangled history of mRNA vaccines604イイネ

新型コロナで死んだ人の25%はIFN-α2に対する自己抗体を持っており18％は自己抗体が中和活性を持っていた。これにより免疫がうまく働かず死に至った可能性

• Antibodies against type I interferon: detection and association with severe clinical outcome in COVID-19 patients

なぜ新型コロナワクチンの11歳以下への承認がこんなに遅れているのか

アメリカでの話ですが安全性を懸念したFDAにより参加者を増やした臨床試験が命じられたためのようです。

新型コロナワクチンは大人向けの承認取得のために3万人が参加した臨床試験が行われましたが、これに続く子供向けの承認のための臨床研は通常ここまで多くの参加者は必要なく、新型コロナワクチンも「免疫ブリッジング」と呼ばれる知見を活用して4500人規模で開始されたそうです。

しかし8月初旬に、FDAが追加安全性データの取得を命じたとのこと。これは大人への投与でまれにも見つかる心臓の炎症などを懸念してとのことと記事で解説されています（記事中には、それを差し引いてもワクチンのメリットは明らかで、心臓の炎症は軽微であり最小限の治療で回復するけれどとしっかり書いてあります。日本のう〇こみたいなメディアとは違いますね）。

結果として5〜11歳の承認申請が9月、緊急使用の承認が10月。これに続き、2〜5歳のデータは10〜11月には揃う。そのあとに承認申請になるそうです。アメリカでは新学期が10月から開始なので子供向けワクチンはまだか？ってニュースが盛んに出てますね。

• 

  Why a Covid-19 vaccine for younger children is taking longer than a vaccine for adults - CNN 1 users30イイネ

　Keyword:子ども/15

コロナに感染して症状が重かった人、平均してIQが7低下。

Cognitive deficits in people who have recovered from COVID-19.Published:July 22, 2021DOI:https://doi.org/10.1016/j.eclinm.2021.101044

• 

  新型コロナに感染するとIQも下がる!?（英研究）｜ニューズウィーク日本版 オフィシャルサイト 10 users1イイネ

• 

  Study Finds COVID-19 May Lower Intelligence 1 users449イイネ

• Cognitive deficits in people who have recovered from COVID-19.Published:July 22, 2021DOI:https://doi.org/10.1016/j.eclinm.2021.101044

これ最初、経済状況が悪い人、IQが低い人がコロナに感染する傾向があってそのアーティファクトじゃないの？と思ったけど感染後の重篤度が高いほどIQが下がっているので、そういうわけではないようです。無症状ではほとんどIQ低下は見られない。

2021年7月に発表されたイギリスの研究者による論文報告です。

↓知能のチェックはこんなテストらしい（論文より）

Cognitive deficits in people who have recovered from COVID-19.Published:July 22, 2021DOI:https://doi.org/10.1016/j.eclinm.2021.101044

これは悲惨。コロナ禍中に生まれた子供は、コロナ感染関係無く平均知能指標が20％低いとの研究結果

Impact of the COVID-19 Pandemic on Early Child Cognitive Development: Initial Findings in a Longitudinal Observational Study of Child Health.doi:https://doi.org/10.1101/2021.08.10.21261846

• 

  Impact of the COVID-19 Pandemic on Early Child Cognitive Development: Initial Findings in a Longitudinal Observational Study of Child Health | medRxiv387イイネ

• Children born during pandemic have lower IQs, US study finds | Coronavirus | The Guardian 2 users1854イイネ

• 

  Babies born during COVID-19 pandemic have lower IQs: Study says958イイネ

• 

  新型コロナ拡大後に生まれた幼児、IQ平均78…「刺激減り低下」（中央日報日本語版） - Yahoo!ニュース 51 users163イイネ

　Keyword:ランニング/7

ファイザーワクチン接種後の戦闘力の変化

投与前の戦闘力は10ちょっと。80歳以下の1回目投与後の平均戦闘力は104.1、2回目投与後には4894.4。
これに対して80歳以上では1回目投与後の平均戦闘力は48.2、2回目投与後は987.2と若年層よりも戦闘力弱め。

※「戦闘力」は(幾何学的平均)抗体力価の誤記です。


Age-related immune response heterogeneity to SARS-CoV-2 vaccine BNT162b2.Nature (2021)

• 免疫学：SARS-CoV-2 mRNAワクチンに対する免疫応答と年齢の関係 | Nature | Nature Portfolio
• Age-related immune response heterogeneity to SARS-CoV-2 vaccine BNT162b2 | Nature

業界最高峰の学術誌Nature Medicineで新型コロナの集団免疫獲得に必要な接種率に関する報告。20％でおk。日本はあと1か月程度で達成出来る見込み。

• Community-level evidence for SARS-CoV-2 vaccine protection of unvaccinated individuals | Nature Medicine 1 users

DNA配列にATGC以外の塩基「Z」を持つウイルスが、多数存在した

• 塩基配列に「Z」を持つウイルスが、多数存在した｜ニューズウィーク日本版 オフィシャルサイト 16 users25イイネ

従来の成分ワクチンがmRNAワクチンに完全敗北。サノフィ／GSKのワクチンの実用化は来年後半に

• 【サノフィ／GSK】ワクチン試験計画に遅れ‐高齢者の免疫応答が不十分｜薬事日報ウェブサイト

　Keyword:GSK/8

日本にも供給される米モデルナ社、臨床試験でコロナワクチンの有効性94.5％と発表

• 動画：米モデルナ、コロナワクチンの有効性94.5％と発表　写真1枚　国際ニュース：AFPBB News

新型コロナでは肺がヒアルロン酸で埋め尽くされて呼吸が出来なくなって死んでいる

• Accelerated hyaluronan concentration as the primary driver of morbidity and mortality in high-risk COVID-19 patients: with therapeutic introduction of an oral hyaluronan inhibitor in the prevention of Induced Hyaluronan Storm Syndrome | medRxiv
• リンク(www.ncbi.nlm.nih.gov...)

Natureで新型コロナの重篤化と関係する遺伝子群が報告、ネアンデルタール人由来

↓（上）染色体ごとの重篤化度との相関関係。（下）強い相関系の見られる3番染色体を保有する地域ごとの比率

出典：The major genetic risk factor for severe COVID-19 is inherited from Neanderthals. Nature (2020)
3199人のCOVID-19で入院した人を対象に遺伝子を調べたところ3番染色体の50kDaの領域に重篤化と高い相関を示す領域が見つかった。この遺伝子はネアンデルタール人由来で南アジア（インドとか）の30％の人が有する。バングラディッシュでは保有者は63%に達する。一方で、ヨーロッパでは8％、アメリカでは4％の人のみが保有している。日本とかで保有している人はほとんどいない。

• The major genetic risk factor for severe COVID-19 is inherited from Neanderthals | Nature 4 users

国内7大学、全ゲノム解析など実施し、新型コロナの重症化因子特定へ

• 国内7大学、新型コロナの重症化因子同定へ全ゲノム解析など実施：日経バイオテクONLINE

日経BP緊急オンラインZOOMセミナー、シリコンバレーから中継「新型コロナウイルス感染症（COVID-19）征圧への道」

• 新型コロナウイルス感染症（COVID-19）征圧への道 1 users

50日間の感染予防対策/30日間の制限無しを繰り返す方法で死亡者を抑えることが出来る（ケンブリッジ大学によるシミュレーション）

ケンブリッジ大学の研究者が16カ国の状況をシミュレーションしています。
その1：ずっと感染予防対策を継続出来るなら
元の図がデカいのでグラフは一部のみ切り取っています（元の図では16カ国でシミュレーション）。縦軸がICUに入る患者数を対数スケールで示しています。それぞれのグラフに入っている横線はそれぞれの国にあるICUベッド数が示してあります。この線を超えるとエライことになるってやつです。

出典：Dynamic interventions to control COVID-19 pandemic: a multivariate prediction modelling study comparing 16 worldwide countries.European Journal of Epidemiology (2020)
グラフ一番左上のオーストラリアでの例で説明します。ICUベッド数は2200とのこと。赤色が感染に対して何もロックダウンしなかった場合、ICUが必要な患者数が最大で6万程度に達しており、死亡者数は20万人と予想されています。この場合だと国民全員が感染しつくすのか190日程度で収束するみたいです。この選択肢もあり？

オレンジ色が感染拡大から20日目に再生産数を0.8（1人が何人を感染させるかを0.8に抑える）に抑える対策を行った場合。ICUが必要な患者数はICUベッド数を上回ることなく220日ぐらいで感染者数ゼロになるみたいです。死亡者数は9400人程度。青色は再生産数を0.5に抑えた場合、120日ぐらいで感染者数ゼロに持って行ってます。死亡者数の予想は5000人。

ただ、対策を講じて感染者をゼロに持って行った場合は、対策を解除したら、外からまた感染者が入ってきて同じことの繰り返しなのかもしれません。

その2：50日間対策、30日間対策無しを繰り返す
さて、次のグラフは感染が始まってから「50日間対策、30日間自由活動OK」を繰り返す対策をとった場合のシミュレーションです。

出典：Dynamic interventions to control COVID-19 pandemic: a multivariate prediction modelling study comparing 16 worldwide countries.European Journal of Epidemiology (2020)
赤色が同じように何も対策をしなかった場合。同様に左上のオーストラリアでのシミュレーションで説明します。

オレンジ色は対策を講じる50日間の間に再生産数0.8に抑えた場合。最初の1サイクルはICUベッド数以下にICUが必要な患者数を抑えられますが、2サイクル目で大きくICUベッド数を超える患者が発生しています。一方で再生数を0.5に抑える対策を行った青色のケースでは何回50日/30日のサイクルを繰り返してもICUベッド数を超える患者数を出さずに済んでいます。

こういった対策をとることで最短期間で死亡者数を最小に抑えて社会的免疫を獲得出来ると考えられます。

まあ経済の事を考えなければ完全ロックダウンを続けてワクチンが出来るのを待つ手もあるのかもしれませんが。。。。。。

• Rolling 50/30 day cycle of lockdown and relaxation could be a useful option for managing COVID-19, model suggests | University of Cambridge

• Rolling 50/30 day cycles of lockdown, relaxation can help manage COVID-19, sustain economy: Study - The Economic Times
• Rolling 50/30 day cycle of lockdown and relaxation could help manage COVID-19
• Dynamic interventions to control COVID-19 pandemic: a multivariate prediction modelling study comparing 16 worldwide countries | SpringerLink

新型コロナ患者のLDH、CRP、ALT、NEU(好中球)数値で10日後の生死を90％の精度で予測可能！

• リンク(www.ncbi.nlm.nih.gov...)
• An interpretable mortality prediction model for COVID-19 patients | Nature Machine Intelligence

イギリスにおける新型コロナに感染した妊婦427人の経過まとめ。妊婦にとって新型コロナ感染はハイリスクではない。

3月1日から4月14日の間に調査。コロナによる悪影響（insidence of hospitalisation)は1000人中4.9名。
9％（40名）が人工呼吸器を使用。12人（5％）の新生児がコロナ陽性。

• Characteristics and outcomes of pregnant women hospitalised with confirmed SARS-CoV-2 infection in the UK: a national cohort study using the UK Obstetric Surveillance System (UKOSS) | medRxiv
• Pregnant women are not at greater risk of severe COVID-19 than other women

• Pregnant women are ‘not at greater risk’ of severe Covid-19 than others | Nursing Times

中国・武漢での病院周辺の空気中に含まれるコロナウイルスRNAが検出されるという研究報告

• コロナウイルス：SARS-CoV-2の遺伝物質がエアロゾルの中から検出された | Nature | Nature Research

ニューヨークで最近2週間に出産した無症状の211人を検査したら29人(14%)が新型コロナ陽性だった

出産する人は出産までに何度も病院に通い、最終的には病院で出産するため感染の機会が多くなることが予想されます。The New York Presbyterian Allen Hospital and Columbia University Irving Medical Center病院で2020年3月22日〜4月4日に出産した215名を新型コロナ検査した結果が報告されています。

215人のうち4人が風邪症状を示しており、PCR検査の結果は全員が新型コロナ陽性だったそうです。そして驚くべきことに無症状の211人のうち、なんと13.7%にあたる29人がPCR検査で新型コロナ陽性と判定されたそうです。

どこの国も無症状の人を新型コロナ検査したりはしないだろうから、積極検査している国でも実際の感染者はもっともっと多いのかもしれませんね。

ここからは個人的コメントですが、この研究結果を見ると、ずいぶん無症状なのに陽性の妊婦の割合が多いように思います。妊婦は若干の免疫抑制状態になっているというのが教科書的な知識です。新型コロナが重症化する要因はサイトカインリリースシンドロームなどの免疫の暴走が原因とのことですし、妊婦は比較的新型コロナに強いのかもしれません。

• Universal Screening for SARS-CoV-2 in Women Admitted for Delivery. DOI: 10.1056/NEJMc2009316(NEJM)